Medikal karbondioksitin çeşitli medikal amaçları vardır. Cerrahi bölgenin daha iyi görülmesi için vücut boşluklarını büyütmek ve stabilize etmek üzere minimal invazif cerrahi (laparoskopi, endoskopi ve artoskopi) için üfleme gazı olarak kullanılabilir. Ayrıca, sıvı fazdayken, cilt yüzeyinde harici uygulamayla kriyoterapi veya lokal analjezi için -76° C'ye kadar sıcaklıklar sağlamak için kullanılabilir.